Bonitace je nesoutěžní ohodnocení daného jedince. Rozhodčí každého psa/fenu hodnotí jak po stránce exteriéru, tak z hlediska povahy, charakteristické pro jeho plemeno. Bonitace je povinná podmínka pro zařazení jedince do chovu. Pro účast na výstavách a zkouškách bonitace není nutná. Podmínkami pro účast na bonitaci (které jsou současně podmínkami pro chov kontrolovaný) jsou členství v Českém klubu německých ovčáků, předvedení na svodu dorostu, zkouška všestranného výcviku nejméně l. stupně (ZV, SchH, IPO), rentgenový snímek na dysplasii kyčelního kloubu max. 2. stupně a výstavní ocenění nejméně „dobrý“ z třídy dospívajících nebo dospělých ze speciálních výstav klubu německých ovčáků. (Pro účast na bonitaci nelze vzít do úvahy ocenění z mezinárodních výstav. Ocenění z národních výstav v uvedených třídách je platné pouze z výstav uskutečněných do 31. 12. 1996.)
Jedinci, kteří s úspěchem absolvují bonitaci, jsou zařazeni do výběrového chovu na dva roky následující po roce, ve kterém byli zařazeni. V roce, kdy končí platnost této první bonitace, se mohou psi zúčastnit bonitace opět a pokud splní všechny podmínky stanovené pro zkoušku povahy, jsou zařazení ve výběrovém chovu doživotně. Jedinci nezařazení ve výběrovém chovu, tzn. jedinci v chovu kontrolovaném, jsou chovní do 8 let věku. Totéž platí pro jedince, kteří se nezúčastnili opětovné bonitace nebo požadované podmínky bonitace nesplnili. Jak vyplývá z výše uvedených skutečností – v současné době existují u německých ovčáků dva druhy chovu. Pokud rodiče splnili podmínky pro účast na bonitaci a bonitace se skutečně úspěšně zúčastnili, potom obdrží jejich štěňata barevně odlišené průkazy původu a označení výběrový chov.
Popis bonitačního kódu:
| První číslice hodnotí celkový vzhled psa | |
| 0 | - zcela netypický vzhled bastarda, |
| 1 | - příliš lehký, chrtovitý |
| 2 | - malý, pod hranicí určenou standardem |
| 3 | - lehký, pří výšce požadované standardem |
| 4 | - požadovaná síla, mohutnost, ušlechtilost, výška psa 60 – 62 cm, feny 55 – 57 cm |
| 5 | - požadovaná síla, mohutnost, ušlechtilost, výška psa 63-65 cm, feny 58-60 cm |
| 6 | - výška v mezích standardu, ale hrubší a méně ušlechtilý |
| 7 | - přerostlý, ale souměrně stavěný, odpovídající mohutnosti a ušlechtilosti |
| 8 | - příliš těžký a málo ušlechtilý |
| 9 | - hrubý, lymfatický |
| Druhé v pořadí je písmeno, které charakterizuje znaky plemenné příslušnosti | |
| A | - jemná hlava |
| B | - strmé úhlení hrudních končetin |
| C | - rovná, krátká záď |
| D | - sražená záď |
| E | - strmé úhlení pánevních končetin |
| F | - krátká stehenní kost |
| G | - neúplný chrup |
| H | - vada skusu |
| J | - správný výraz NO, výborně zaúhlený |
| K | - dlouhý hřbet |
| L | - příliš dlouhý |
| M | - kvadratický |
| N | - mělký hrudník |
| P | - těžší hlava |
| R | - vadný ocas |
| S | - příliš poddajné vazy |
| Třetí v pořadí jsou písmena, která se zabývají uchem, okem a pigmentem barvy | |
| O | - světlé oko |
| T | - ztráta pigmentu |
| U | - vlkošedý, světlé znaky |
| V | - vlkošedý, tmavé znaky |
| W | - vadné uši |
| Q | - sytý pigment |
| I | - černý, světlé znaky |
| X | - černý, tmavé znaky |
| Y | - celočerný; |
| Z | - dlouhá srst |
| Na čtvrtém místě jsou číslice značící povahové vlastnosti (odvaha a bojovnost) | |
| 1 | - výrazný |
| 2 | - dobrý |
| 3 | - dostatečný (nemůže být zařazen do 1. třídy chovnosti) |
| 4 | - nedostatečný (nesplnil podmínky pro zařazení do výběrového chovu) a fena s touto známkou může mít pouze jeden vrh ročně |
| V bonitačním řádu platném do 30.9. 1990 byly číslice značící povahové vlastnosti zadávány takto: | |
| O | - zcela bázlivý, z chovu vyřazen |
| 1 | - nervózní, bojí se střelby, z chovu vyřazen |
| 2 | - záludný, nedůvěřivý, bázlivý |
| 3 | - dráždivý, napadající, málo sebevědomý |
| 4 | - zuřivý, útočný, těžko ovladatelný |
| 5 | - odvážný, tvrdý (vůči úderu), útočný, dobře ovladatelný |
| 6 | - odvážný, útočný, citlivý vůči úderům |
| 7 | - klidný, málo odvážný, blokuje |
| 8 | - lhostejný, pevných nervů, těžko vydrážditelný |
| 9 | - zcela flegmatický, z chovu vyřazen |
Za čtvrtou číslicí bonitačního kódu následuje lomítko
Za lomítkem se píše buď písmeno N – pes po zákroku na figuranta nepouští nebo písmeno P – pes pouští. Písmena za pouštění a nepouštění však nemají vliv na třídu chovnosti, tzn. na celkový výsledek bonitace.
Do 30.9. 1990 se za lomítkem mohly vyskytovat číslice značící bojovnost a tvrdost.